Если мы захотим смоделировать наш мозг по сравнительно упрощенной модели, например топологической, где нейронная сеть рассматривается как некий граф, в вершинах которого находятся нейроны, а ребра графа- это связи между нейронами, то проблема подсчета количества нейронов продолжает оставаться фундаментальной. Существует общая и приемлемая оценка, что количество нейронов порядка ста миллиардов. Однако, если подойти несколько точнее к методикам подсчета, например к методике Golgi, удостоенной Нобелевской премии, то можно понять, что речь идет о достаточно грубых приближениях. Проблема здесь не только в том, что данный метод обнаруживает не все нейроны, так как , даже если бы это и удалось, остается проблема плотности распределения нейронов , которая не одна и та же в разных областях мозга. Так, мозжечок, который по размерам меньше половины объема мозга, содержит половину всех нейронов. Но и в отдельной области мозга, подсчет связан с большими сложностями, так как количество имеющихся связей огромно, и представляет собой сложнейший комплекс, разделение элементов которого не представляется легким.
Все это практически означает, что изменение методики может вызвать значительную разницу в подсчете. Так,согласно бразильской методике, опубликованной в Found of Comparative Neurology, человеческий мозг содержит около 86-и миллиардов нейронов. Следовательно, даже на уровне подсчета , не говоря уже о структуре сети, возникают трудности в изучении мозга. Поэтому, необходимо думать о новых конкретных методиках, использующих новые технологии, такие как нанотехнологии с лазерным применением, дающие точную картину. В этом случае мы сможем с точностью оценить количество нейронов с тем, чтобы перейти уже к изучению структуры, исследуя вопросы нейронных связей.